有关人类文明的大部分历史伴随着湮没于湖泊、 大海和海洋底部的古城被埋藏在了水底。有些古城在千百万年前爆发的地震海啸和其它自然灾害的外力之下沉入了水底。由于意外发现或科技创新，许多水底城直到最近才陆续浮出水面，为人所知。一些水底城的发掘甚至引发了科学家们对人类文化的质疑。
埃及亚历山大市（Alexandria, Egypt）:
考古学家认为在亚历山大帝的城堡亚历山大市近海岸躺着克利欧佩特拉皇室的废墟。考古学家推断造成亚历山大市藏身海底的原因是1500年前爆发的一次地震，随同沉没还有克利欧佩特拉宫殿的器皿雕像等。亚历山大市甚至计划向游客开发水下观光，一睹这一水底奇观。
印度坎贝湾（Bay of Cambay, India）：
考古学家在几年前发现了一座规模宏大具有9500年历史的古城废墟。这座水底废墟保留了这完整的建筑结构和人类遗物。更为重要的是，这个发现将印度历史推前了5000年，迫使历史学家不得不重新审视印度的文明史。被发现的印度杜瓦卡尔或金城得名于一座海底古城，据说是它是印度克利须那神的行宫。
泰国帕夭府（Kwan Phayao, Thailand）：
泰国帕夭府似乎是一座独具特色的建筑，就在泰国帕夭大湖(Phayao Lake)底坐落着一尊具有500年历史之久的寺庙。大约70年前，泰国人开凿了泰国帕夭大湖(Phayao Lake)，近年来泰国境内关于重修帕夭大湖(Phayao Lake)湖底寺庙可能需要花费数十亿资金的议案一直争论不休。然而，由于破碎后的泰国帕夭大湖(Phayao Lake)一直是鱼类的栖息地，许多人认为应该保持它目前的原生态面貌。
日本与那国岛（Yonaguni-Jima）：
大约20年前，一位潜水向导在日本海岸发现了与那国岛，从此有关与那国岛上坐落着神秘锥形建筑物的事件所引发的争议就炸开了锅。这些建筑物都是从地球化过程中的基岩雕刻出来的，但就日本古代文明使用的工具而言，要雕刻出这座神秘的锥形建筑物似乎令人难以置信。
古巴哈瓦那（Havana, Cuba）：
一组科学家继续探索着在靠近古巴的犹加敦海峡发现的巨石废墟。他们发现了沿着海岸线绵延的庞大城市集群。有些科学家认为这些城市集群所蕴含的文明会使美国文化愈久弥深。目前，科学家们只能在计算机的辅助下绘制这个水底城的电脑模型图。
欧洲北海（North Sea, Europe）：
最近，考古学家们在北海发现了狩猎者们于10000多年前占领的一片消失的自然大陆。这片曾今河流湖泊和海洋遍布的海底大陆如今全然沉没在了海底，只能借助数学绘图呈现它的全貌。
南极亚特兰蒂斯（Atlantis, Antarctica）:
一百多年前，一位伊斯坦布尔市的博物馆馆长做了一个惊人的发现。他在考对一副羚羊皮制作的地图时发现了一处标有山脉的地方，那就是现在的南极洲。这副地图出人意料地成为了人们极力维护并声称南极洲就是传说中消失的亚特兰蒂斯城邦的一部分零碎的证据。其他的证据还包括最近（借助声纳技术）发现的南极洲海底大陆以及古代制图师使用的地图应用系统，这些都表明亚特兰蒂斯可能早已远离了地中海。